Este servicio dirige y coordina todas las actuaciones relativas a la Contabilidad Financiera de la Universidad de Cantabria. Se responsabiliza, entre otras cosas, de elaborar y tramitar los documentos contables, del mantenimiento de los datos bancarios de los proveedores, realizar los procesos de pago, mantener actualizado el Plan General de Contabilidad Pública y los conceptos de gastos, ingresos y operaciones no presupuestarias, y realizar los procesos de cierrre y apertura del ejercicio presupuestario.