Hasta la aprobación del Reglamento de Régimen Interno que establecerá su organización en Departamentos, la investigación de los grupos que trabajan en el IBBTEC se divide en dos grandes áreas:

• Microbiología

Investigadores principales:

• Elena Cabezón
• Fernando de la Cruz
• Juan M. García-Lobo
• Matxalen Llosa
• Gabriel Moncalián 
• Hrvoje Petkovic
• Jesús Sainz

• Señalización Celular

Investigadores principales:

• Piero Crespo
• Javier León
• Juan López-Giménez
• Ramón Merino
• Angel Pazos
• Marian Ros